الهدف العام لاتحاد الطب الرياضي الأردني هو المحافظة على صحة لاعبي الاتحاد الرياضية بما يكفل الارتقاء الى الأداء الأمثل دون أثار سلبية على صحتهم وذلك من خلال:
1- الإشراف على اللقاءات والبطولات الرياضية التي تشارك فيها المنتخبات الوطنية.
2- الفحص الدوري للاعبي المنتخبات الوطنية ومتابعتهم.
3- الإشراف على معالجة لاعبي الاتحادات الرياضية والتوصية بتحويل الحالات التي تحتاج للمعالجة للمستشفيات.
4- إصدار النشرات الطبية لتوعية الرياضيين في امور الطب الرياضي وما يتعلق بالرياضة دورياً.
5- التنسيق مع وزارة الصحة والدفاع المدني ومركز الطب الرياضي للقيام بمهمة الإشراف الطبي للبطولات واللقاءات الرسمية.
6- تقديم الرعاية والاستشارة الطبية للأندية الرياضية الراغبة في الاستفادة من خبرات الأعضاء لمعالجة اصابات اللاعبيين.
7- توعية الكوادر العاملة في الرياضة بشكل عام صحياً.
8- العمل على نشر وتطوير مفهوم الطب الرياضي في الأردن.